科學家們揭示了一種蛋白質中前所未有的現象:這種酶單獨處理DNA和RNA,但當它與另一種蛋白質結合成為防御系統的一部分時,會與一種完全不同的化合物相互作用,幫助細菌自殺。
這一發現是在研究人員集中精力詳細研究這種防御機制如何在被噬菌體感染的細菌中發揮作用時得出的。噬菌體是一種在細菌細胞內侵入并復制自身的病毒。除了詳細描述蛋白質的結構和結合位點外,實驗還揭示了這種前所未有的酶功能轉換。
資深研究作者、俄亥俄州立大學醫學院生物化學和藥理學助理教授傅天民(Tianmin Fu)說:“這是一個重大發現,當蛋白質形成復合物時,通常會增加或降低酶的活性,但我們從未見過功能上的完全轉換。這對酶學領域來說是全新的。”
他說,從更廣泛的角度來看,更好地了解細菌是如何利用防御系統死亡的,而不是被噬菌體感染,可以轉化為說服癌細胞也規劃自己死亡的療法。
傅教授說:“如果我們能將這種類型的系統引入癌細胞,這可能開發出新一代的癌癥治療策略。”
這項研究12月13日發表在《分子細胞》雜志上。
當被噬菌體感染時,細菌會選擇死亡,以防止噬菌體接管細菌群落。這項研究中檢測的復合體是SIR2和HerA蛋白質的組合,它與其他數百種細菌防御系統一起,在以前側重于基因組分析的研究中被發現。
在大腸桿菌模型中,研究人員使用低溫電子顯微鏡來確定蛋白質單獨以及它們作為超分子復合物組裝期間和之后的生化結構。
“這個系統已經在許多不同的細菌中被發現,盡管我們在大腸桿菌中研究了它,但我們認為它在其他細菌中的作用非常相似。”
分析表明,SIR2和HerA相互具有親和力,表明SIR2的輪狀結構在兩者形成由6個相同的分子亞基組成的復合物之前起著HerA分子簇組織者的作用。然而,究竟是什么觸發了它們之間的聯系仍然是個謎。
結果表明,一旦組裝,該復合物可以在細菌中存在而不會發生意外,這表明細菌以某種方式抑制了系統的防御活性,除非噬菌體進入現場。當噬菌體被引入時,細菌很快就死亡了——這是它們自己設計的,因為防御系統已經被激活,耗盡了細菌生存所需的一種叫做NAD+的小分子。到目前為止,這種激活機制仍然未知。
實驗證實,SIR2會丟棄NAD+,這讓人大吃一驚。SIR2作為核酸酶的首要任務是消化核酸以維持正常的細胞功能。但是當與HerA結合并作為防御系統的一部分被激活時,它的酶功能發生了變化——SIR2變成了一種完全不同類型的酶,稱為NADase,它產生水基反應來釋放NAD+。
“我們現在想要解決這個巨大的、基本的生物學問題——復雜的組裝是如何將SIR2的活性從核酸酶轉換為NADase的? 弄清楚這種機制對這個領域來說意義重大,這個系統非常有趣,因為它在一個預組裝的復合體中有如此多不同的酶活性?!?
傅教授還設想了一個未來的合成生物學工具箱,在這個工具箱中,細菌的小把戲被改編成殺死癌細胞的策略。他說:“我們開始向細菌學習,希望我們可以將它們重新編程為癌癥診斷和治療的有力工具。”